Große Aufmerksamkeit hatte Magirus im M 2000 auf angenehmes Klima im Fahrgastraum durch eine leistungsfähige, einfach zu bedienende und wirksame Lüftungs- und Heizungsanlage gerichtet. Auf jeder Seite im Dach gab es drei voneinander getrennte Kanäle für Permanentbelüftung bzw. -temperierung, individuelle Düsenbelüftung und Entlüftung des Innenraums. Die Anlage arbeitete nach dem Staudruckprinzip, saugte verbrauchte Luft im Unterdruckbereich vorn ab, wobei die Absaugung über Kanäle auf der gesamten Wagenlänge erfolgte, und beheizt wurde das Wageninnere durch Medium- und Zusatzheizung vom Boden aus. Zur Heizungsanlage mit thermostatischer Temperaturregelung gehörte außerdem ein Bugschrank für die primäre Versorgung des Fahrerplatzes einschließlich Entfrostung der Frontscheiben, aber auch zur zusätzlichen Versorgung des Innenraums mit Warmluft.
Heizung sowie Be- und Entlüftung im neuen M 2000 schematisch dargestellt.
Drei getrennte Luftkanäle im Dach.